%d8%aa%d9%88%d8%a7%d8%ac%d9%87-%d9%82%d9%88%d8%a7%d8%b9%d8%af-%d8%a8%d9%8a%d8%a7%d9%86%d8%a7%d8%aa-%d8%a7%d9%84%d9%83%d8%a7%d8%a6%d9%86%d8%a7%d8%aa-%d8%a7%d9%84%d8%ad%d9%8a%d8%a9-%d8%a7%d9%84%d8%aa

أصبح مستودعًا رئيسيًا لمجتمع أبحاث الفاكهة في العالم ضحية غير متوقعة صراع جامعة هارفارد المستمر مع الإدارة من الرئيس الأمريكي دونالد ترامب. في مايو ، جمدت الإدارة أكثر من 2.2 مليار دولار أمريكي من الأموال الفيدرالية التي مُنحت للجامعة ، بما في ذلك منحة المعاهد الوطنية للصحة (NIH) التي دعمت المستودع ، ودعا flybase. رفعت جامعة هارفارد ، التي يقع مقرها في كامبريدج ، ماساتشوستس ، دعوى قضائية لإنهاء تجميد التمويل ، وكانت القضية تشق طريقها عبر المحاكم.

لكن الأضرار التي لحقت Flybase كانت فورية وشاملة. تم تسريح موظفيها الثمانية – بما في ذلك منسقي قواعد البيانات Sian Gramates و Victoria Jenkins ، وكلاهما في هارفارد – و Subawards الذين قاموا بتمويل المتعاونين في ثلاث جامعات أخرى. كان Gramates في Flybase لأكثر من 20 عامًا ، وكان يتطلع إلى التقاعد. تقول جنكينز إنها تسعى الآن للحصول على فرص خارج العلوم. عندما يغادرون ، سوف يأخذون معهم عقودًا من المعرفة المؤسسية حول واحدة من أفضل الكائنات النموذجية في علم الأحياء ، ذبابة الفاكهة ، ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر.

وضع Flybase فريد من نوعه ، لكنه ليس المورد الوحيد الذي يكافح. توجد قواعد بيانات حية متشابهة (MODS) للفئران والفئران والزرد والخميرة والضفادع والديدان اليرمي Caenorhabditis elegans والنبات أرابيدوبسيس ثاليانا. بشكل جماعي ، قامت هذه المستودعات – التي تدعم مئات الآلاف من الباحثين بينهم – بدعم عقود من الاكتشافات العلمية وعملت كمراكز لمجتمعاتهم البحثية. لقد تم دعمهم جميعًا بشدة من قبل المعاهد الوطنية للصحة ، والآن يواجهون خسارة هذا التمويل بسبب التخفيضات الواسعة لدعم البحوث الفيدرالية ، مما يدفع عمليات التسريح والاضطرابات التي تخاطر بالعلوم الأساسية.

يقول جينكينز: “من الصعب المبالغة في المبالغة في قيمة هذه الموارد والفرق التي تشرف على تنظيمها ، وهو ما يجعلها حقًا هذه الأدوات القيمة”. “بدونهم ، من الصعب تخيل أن الأبحاث مستمرة في أي شيء بالقرب من السرعة والجودة التي رأيناها في الماضي.”

فرقة وزارة الدفاع

منذ أوائل التسعينيات ، مع تقدم التقدم في تقنية التسلسل ، خلقت وفور من المعلومات الجديدة التي تحتاج إلى تنسيق ، برزت MODS كسلطات لجينومات أنواعها الفردية. تحتوي هذه المواقع عادةً على بيانات منسقة ومشروحة حول وظيفة الجينات والتعبير عنها ، والأليلات المظهرية والمتغيرات ، وجمعيات الإدمان البشري وتفاعلات البروتين-وكذلك موارد المجتمع مثل أدلة الباحثين والمنتديات. على الرغم من أهميتها ، أ تم نشر preprint الشهر الماضي أشار إلى أن مثل هذه المستودعات المركزية قد تكون ضعيفة ، جزئيًا بسبب تحويل أولويات السياسية أو التمويل¹.

في عام 2016 ، أطلقت المعاهد الوطنية للصحة محاولة لتوحيد ثمانية من هذه المستودعات في منظمة رائدة واحدة ، تحالف موارد الجينوم، التفكير في أن الإسكان هذه التعديلات معًا من شأنه أن يوحد معلوماتهم والبنية التحتية ويجعلها أسهل في الاستخدام. أعطيت كل مجموعة أعضاء حتى عام 2029 لترحيل بياناتهم وقيل لها أن تمويلها سوف يتناقص مع مرور الوقت. الآن ، مع أقل من خمس سنوات للذهاب ووسط أ فترة الاضطراب العلمي في الولايات المتحدة ، تواجه قيادة وزارة الدفاع تحديًا شاقًا.

العديد من التعديلات دمج جزء صغير فقط من بياناتهم في التحالف – في بعض الحالات ، أقل من 10 ٪ ، كما تقول المصادر. يقول ستاسيا إنجل ، مدير المشروع في جزء من القضية Saccharomyces قاعدة بيانات الجينوم (SGD) ، التي يقع مقرها في جامعة ستانفورد في بالو ألتو ، كاليفورنيا ، هي أن تنسيق الكثير من المعلومات ليس تافهاً. كل مجموعة لديها احتياجات مختلفة وأنواع البيانات والبروتوكولات ، وفشل الباحثون في التوصل إلى إجماع على رؤية واحدة موحدة للتحالف.

نظرًا لأن التمويل قد تم تخفيفه بعيدًا ، فقد تضاعفت المشكلة: لا يمكن أن تحتفظ Mods بموظفيها ، ومع وجود عدد أقل من الموظفين ، يصبح تكامل البيانات أكثر صعوبة. وفي الوقت نفسه ، لا يتم تخصيص المبلغ الإجمالي من المنح الفردية التي يتلقاها كل وزارة الدفاع حاليًا بالكامل للتحالف ، الذي يواجه التخفيضات الخاصة به. تقول كارول جولت ، أخصائية وراثية في مختبر جاكسون في بار هاربور ، مين ، ومحقق مستحق للمحقق الرئيسي في التحالف والمحقق الرئيسي لقواعد قاعدة بيانات الجينوم الجينوم: “ليس لدينا ما يكفي من الوقت أو الموارد لجعل الأمور تحدث بشكل فعال كما نود”.

في غضون ذلك ، أطلقت بعض التعديلات دعوات للتبرعات ، والتي نظرت في تطبيق ما هي الرسوم الطوعية سابقًا لاستخدام المنصات أو العمليات الموقف. قاعدة بيانات Nematode Wormbase ، التي تم إطلاقها في عام 2000 ، أعلن الذي – التي سيحتفل أكتوبر آخر تحديث كبير له بحيث يمكن أن تكرس نفسها بالكامل للاندماج في التحالف ، في حين لاحظت SGD في رسالة إخبارية في أبريل أن التخفيضات من المعاهد الوطنية للمعاهد الوطنية كانت تستمر في “توتر” مواردها المالية. (يقول الممثلون في كل من SGD و Wormbase إنهم فقدوا أيضًا الموظفين أو اضطروا إلى خفض العلاقات مع المتعاونين بسبب تخفيضات الميزانية.)

يقول إنجل: “يمكنك أن ترى أن الجميع يتدافعون لتغطية نفقاتهم”. “في بعض النواحي ، يبدو أننا قد تم تسليمنا مهمة مستحيلة.”